Nombre del proyecto: “Identificación y seguimiento de patógenos emergentes y reemergentes”
- Director: Dr. Julio Cartagena
Objetivo general (Descripción técnica): Diseñar e implementar una plataforma de bajo costo para la detección y cuantificación simultánea de patógenos virales y bacterianos mediante PCR en tiempo real.
Descripción: ICTIO Biotechnologies ha desarrollado un kit que es capaz de detectar y estimar la cantidad, de manera simultánea, de los principales patógenos que afectan a la salmonicultura chilena. El kit incluye los reactivos necesarios para extracción de material genético (ácidos nucleicos como ADN y ARN) desde tejidos blancos como bazo, riñón y/o corazón, además de los partidores y ADN de referencia (control positivo) requeridos para el análisis molecular mediante PCR en tiempo real (qPCR, quantitative Polymerase Chain Reaction), donde se amplifica y cuantifica el material genético de los patógenos en busqueda. El diseño de los partidores en conjunto con la optimización de las condiciones de amplificación de nuestro kit, permite que la detección por PCR en tiempo real para cada uno de los patógenos marinos se pueda realizar en el mismo análisis (es decir la misma corrida). Los patógenos que nuestro kit es capaz de detectar y cuantificar son los virus ISAV, IPNV y PRV, y las bacterias Piscirickettsia salmonis, Flavobacterium psychrophilum, Renibacterium salmoninarum, Vibrio ordalii y Yersinia ruckeri.
Status: A la fecha se han elaborado prototipos del kit, los cuales han sido probados por varios laboratorios externos. Además, en estos momentos el kit se encuentra en la última fase de factibilidad de validación siguiendo los requerimientos de la Norma Técnica N° 3 de Sernapesca, se espera terminar con este proceso en agosto de 2018.
Beneficios del proyecto: En la salmonicultura es importante disponer de un diagnóstico rápido y certero de los patógenos que infectan y que producen enfermedades en los peces de cultivo. En esa línea, nuestro kit de detección y cuantificación de patógenos permitirá al usuario obtener resultados más rápidos haciendo que los análisis por PCR en tiempo real para distintos patógenos se realicen en paralelo en una misma corrida.
